L’amplification par PCR, pour les anomalies génétiques à profils simples

Pour caractériser des cancers aux profils moléculaires simples, Ipsogen utilise la PCR ou "Polymerase Chain Reaction"  qui combine simplicité d’utilisation et grande sensibilité. Cette technique d’amplification enzymatique permet, à partir d’un échantillon complexe et peu abondant, de produire en quelques heures des millions de copies de la séquence ciblée.

Ipsogen utilise des versions avancées de cette technologie, appelées RQ-PCR ou "PCR quantitative" dans les leucémies. Une copie du "transcriptome" (l’ensemble des gènes exprimés par la cellule à un instant donné) est soumise à l’amplification spécifique de gènes cibles, permettant la mesure précise de leurs niveaux d’expression respectifs.

Les puces à ADN pour les signatures moléculaires à profils complexes

Pour établir le diagnostic moléculaire de maladies complexes comme les cancers du sein, résultant d’un nombre important d’anomalies génétiques, Ipsogen  utilise des puces à ADN qui permettent de mesurer simultanément le niveau d’expression de plusieurs milliers gènes et s’accommodent d’échantillons de petite taille comme les biopsies prélevées à l’aiguille fine.

Parmi les fournisseurs de puces à ADN, Ipsogen a choisi la société Affymetrix, leader mondial de cette technologie et plateforme de référence de nombres d’instituts Européens et Américains.

Ipsogen a développé des algorithmes propriétaires pour exploiter les données et analyser les résultats.

Depuis sa création, Ipsogen dispose d’un réel savoir-faire dans le domaine de la bioinformatique qui lui a permis de développer des algorithmes propriétaires dédiés à l’exploitation et l’analyse des profils d’expression.
Ainsi, une fois le profilage pangénomique de la tumeur réalisé, les données sont transmises électroniquement puis analysées par les équipes d’Ipsogen. Les résultats des tests obtenus sont retournés via Internet aux laboratoires de pathologie ou aux hôpitaux clients.